第九条　　各地环境保护行政主管部门结合本地区的实际情况，在申报登记的基础上，分期分批对重点污染源和重点污染物实行排放许可证制度。

　　第十条　　排污单位必须在规定的时间内，持当地环境保护行政主管部门批准的排污申报登记表申请《排放许可证》.。

　　第十一条　　地方环境保护行政主管部门在本地区内实行污染物排放总量控制，应根据水体功能或水质目标的要求进行总量分配，根据水污染和污染物排放现状，确定污染物削减量。

　　第十二条　　地方环境保护行政主管部门，根据当地污染排放总量控制的指标核准排污单位的排放量。
对不超出排污总量控制指标的排污单位，颁发《排放许可证》。
对超出排污总量控制指标的排污单位，颁发《临时排放许可证》，并限期削减排放量。

　　第十三条　　有下列情形之一者，《排放许可证》和《临时排放许可证》须报国务院环境保护行政主管部门审查核准污染物排放量：
（一）跨越省、自治区、直辖市界区的排污单位；
（二）特殊性质的排污单位（如核设施、绝密工程等）；
（三）特大型（投资2亿元以上）的建设项目（报国务院审批）。

　　第十四条　　《排放许可证》的有效期限，由当地环境保护行政主管部门规定。《排放许可证》的有效期限最长不得超过5年；《临时排放许可证》的有效期限最长不得超过2年。
《排放许可证》在有效期满前3个月，排污单位必须重新申请换证。

　　第十五条　　持有《排放许可证》或《临时排放许可证》的排污单位，不免除缴纳排污费和其它法律规定的责任。